Белки. Биосинтез белка, регуляция. Патология обмена белков, страница 14

 Белки с  лейциновым доменом  застежки - молнии сочетают при этом  обе функции и образование димера и связывание с ДНК. В белке имеются участки богатые гидрофобными аминокислотами (часто лейцином) радикалы которого выступают из a спиральной структуры этого белка. Два белка с такими участками могут формировать суперспираль в которой  выступающие группы радикалов  лейцина взаимодействуют  с лейциновыми  радикалами другого мономера подобно  застежке - молнии. Димер при этом приобретает Y- форму. Ножки этой структуры содержат участки узнавания последовательности ДНК. Область лейциновой  застежки - молнии присутствует в многих связывающих ДНК белках, типа c-Myc,  C/EBP и т.д.

Инициация транскрипции - основное место действия регуляторов на синтез белков у прокариот


Первые данные о механизмах регуляции экспрессии генов получены при исследовании процессов адаптации микроорганизмов к меняющимся условиям окружающей среды. Полвека назад было введено понятие оперон  для  участка ДНК, кодирующего строение, как правило, функционально связанных белков и содержащего регуляторную зону, контролирующую синтез этих белков. Структурные гены, индуцируемые совместно располагаются на молекуле ДНК рядом с последовательностями нуклеотидов, называемых промотором и оператором. Для регуляции транскрипции необходим еще один участок ДНК - регуляторный ген, не всегда располагающийся вблизи вышеописанной группы. Во время транскрипции РНК-полимераза связывается с промотором и продвигается вдоль ДНК, образуя транскрипт генов оперона. Белки-репрессоры - продукты трансляции регуляторных генов, связы

 Рис..Схема влияния триптофана на работу оперона.

ваются с соответствующими операторными участками и блокируют продвижение РНК-полимеразы, и, следовательно, препятствуют транскрипции. В самом простом варианте этот механизм можно рассмотреть на примере триптофанового оперона кишечной палочки. Оператор триптофанового оперона представляет собой последовательность нуклеотидов, узнаваемую репрессором этого оперона, относящегося к белкам со структурой спираль-петля-спираль. Присоединение репрессора структурно  блокирует доступ к промотору РНК-полимеразы, предотвращая экспрессию триптофанового оперона. Присоединение репрессора к оператору становится возможным лишь в том случае, если к репрессору присоединятся 2 молекулы триптофана.

Молекулы триптофана изменяют конформацию репрессора, обеспечивая  возможность его a -спиральным участкам  соединиться  с группами нуклеотидов  большой бороздки ДНК в области оператора. Такое влияние продукта гена регулятора получило название негативного контроля, гены, кодирующие такие регуляторы, названы генами репрессоров, а молекулы, способствующие такой реакции репрессора, получили название корепрессоры. Роль корепрессоров в клетке часто выполняют конечные продукты метаболических  путей.


Несколько иной принцип  регуляции складывается при работе lac-оперона  у той же Рис..Схема работы lac-оперона.

кишечной палочки. lac оперон состоит из одного  гена-регулятора  (i ген) и трех структурных генов (z, y, и a).  Ген i кодирует репрессор lac оперона. Z ген кодирует  b-галактозидазу, ответственную за гидролиз дисахарида лактозы на  ее мономерные  единицы, галактозу и глюкозу. Y ген кодирует  пермеазу, которая  увеличивает проницаемость  клетки к b-галактозидам, а  ген  a - трансацетилазу. При выращивании кишечной палочки на среде, содержащей глицерол в качестве единственного источника углерода, lac репрессор связан с оператором и РНК-полимераза не может присоединиться к оператору. Оперон выключен. Лактоза, добавленная в среду, связывается  с репрессором и резко снижает его способность связываться с оператором. Это обеспечивает присоединение РНК-полимеразы  к промотору, но синтез РНК становится  возможным лишь только в том случае, когда к участку ДНК, расположенному выше (к 5’концу) промотора присоединится еще один белок, названый  САР (катаболитами активируемый белок). Этот белок является рецептором цАМФ, уровень которой в клетке определяется уровнем  глюкозы (снижение количества глюкозы в питательной среде приводит к повышению уровня цАМФ в клетке).  САР, связанный с цАМФ, присоединяется к ДНК и стимулирует РНК-полимеразу, при этом ее активность увеличивается в  20 –50 раз.

  Все возможные варианты ответа оперона на изменения компонентов питательной среды  показаны на рис.10-21.  В отличие от триптофанового оперона, где роль включателя оперона выполнял один сигнал (триптофан), в случае lac оперона требуются 2 сигнала, причем лактоза оказывала положительный эффект, а глюкоза – пример негативного контроля. Небольшие молекулы, которые подобно лактозе могут связываться с белками-репрессорами и ингибировать их способность связываться с операторными участками ДНК получили название индукторы. Индукторами транскрипции служат субстраты метаболических путей. Они стимулируют синтез белков, обеспечивающих их превращения.

Значительно более сложными являются механизмы регуляции инициации транскрипции у эукариот. Можно выделить 2 важнейшие стороны такого различия. Во-первых, РНК-полимераза эукариот не может сама  катализировать синтез РНК без участия специальных белков –факторов  транскрипции, которые должны присоединиться к промотору и самой полимеразе, при этом существует довольно широкие возможности по управлению скоростью транскрипции путем сочетания этих факторов. Вторая отличительная  особенность регуляции инициации транскрипции  у эукариот это то, что факторы регуляции могут оказывать влияние на промотор, присоединяясь к ДНК на расстояниях в тысячи пар оснований от промотора, что позволяет оказывать влияние на один промотор множеству регуляторных белков. далеких расстояниях от промотора,

Для инициации транскрипции у эукариот требуются дополнительные факторы