Биохимия фактора IX и молекулярной биологии гемофилии B, страница 5

Serine Protease Область

C-терминал часть фактора IX демонстрирует отмеченную гомологию последовательностей с проферментами serine proteases, типа trypsin и chymotrypsin. Эта область(регион) - почти 250 аминокислот долго и содержит, в скрытой форме, фермент активное местообитание фактора IXa. Механизм активации фермента вовлекает процесс известный как ограниченное расщепление белка. На дроблении пептидных связей, профермент быстро преобразован(конвертирован) к его форме фермента. Дробление двух пептидных связей в факторе IX ведет к поколению фактора фермента IXa. Фермент активное местообитание обычно к всему serine protease и содержит ферментативные машины для гидролиза пептидных связей. Добавленный на этой родовой структуре - расширенная(продленная) подложка обязательное местообитание, окружая активное местообитание, которое определяет высокую специфику подложки фактора IXa к белковым подложкам.

Обязательные по кальцию Свойства

Фактор IX связывает с металлическими ионами. Как с другим витамином белки K-зависимых, кажется,  имеется два класса(занятия) металлически - обязательных местообитаний: высокая близость и более низкая близость. MLID79005660 82 g-car- boxyglutamic кислотная область определяет некоторых, но не все, этих металлически - обязательных местообитаний, так как фактор IX химически измененный удалением g-carboxyglutamic кислотной области все еще сохраняет обязательное по кальцию местообитание с  высокой близостью. MLID84185715 68 Подобных результатов демонстрировались в факторе IXa. MLID85279476 83 обязательное по кальцию местообитание было ограничено к первой EGF области фактора IX. MLID90151623 84 Asp 47, Asp 49, Gln 50, и Asp 64 вовлечены в закрепление кальция в пределах первой EGF области. MLID91232585 85 второй металл с  низкой близостью обязательное местообитание может присутствовать в области(регионе) Phe 77. MLID90151623 MLID91232585 84,85 Astermark и другие. MLID91115865 86 демонстрировали, что, в то время как g-carboxyglutamic кислота и EGF области могут связывать ионы кальция независимо, неповрежденные g-carboxyglutamic кислота - EGF области связывают ионы кальция с более высокой близостью. MLID91115865 86 контакта Межобласти и стабилизация были также обнаружены в той тепловой денатурации g-carboxyglutamic кислоты - EGF модулей - 10єC выше тогда g-carboxyglutamic кислотная один область. MLID93231988 87 обязательное по кальцию местообитание с  высокой близостью также было описано в тяжелой цепи фактора IX вовлечение остатков 235, 237, 240, и 245. MLID92108008 88

Два класса(занятия) металлически - обязательных местообитаний были идентифицированы, и в факторе IX и протромбине, используя устройство-определенные антитела. MLID87222379 MLID87033727 89,90 Занятия из этих двух классов(занятий) металлически - обязательных местообитаний ведет к двум последовательным конформационным изменениям в этих белках. Первое конформационное изменение, вынужденное(вызванное) магнием и многими другими двухвалентными катионами, связано с закалкой собственной флуоресценции. Второе, металлически - отборное конформационное изменение только вынуждено(вызвано) ионами кальция. Антисвязывающие домены устройство-определенных антител, направленных против фактора IX после того, как это подверглось конформационному переходу который является отборным ионом кальция, блок закрепление фактора IX к пузырькам фосфолипида и активации фактора IX фактором XIa. Это обнаружение говорит, что конформер, достигнутый только в присутствии кальция необходим для выражения обязательного по фосфолипиду местообитания и для закрепления фактора IX фактором XIa.

Мембранно - обязательные Свойства