Взаимодействие белка-белка. Белок в сложной клеточной окружающей среде

Burgess и коллеги в Университете Висконсина идентифицировали обязательный участок для важного взаимодействия белка-белка один между p ' подединица бактериального RNApotymerase и фактора транскрипции o. Это обязательное взаимодействие начинает (вводит) транскрипцию гена и синтез белка.

C Проект Человека Геном, быстро приближающийся к закрытию, исследователи поворачиваются все более и более к задаче преобразования скоро, чтобы быть законченными DNA последовательность в информацию, которая потенциально улучшит - и возможно даже реконструируемую человеческую медицину (лекарство) и здравоохранение. Один из ключа бросает вызов вперед: понимая proteomics, наука клеточной вселенной белка.

proteomics, в некотором смысле, является более сложным чем genomics, не только, потому что есть так много возможных взаимодействий среди белков, но потому что есть так намного больше белки чем гены. Посыльный rnas - РАСШИФРОВКИ СТЕНОГРАММЫ genomic DNA, что непосредственно кодирует, можем белками быть собранным многими различными способами. И выраженные белки типично изменяются в разнообразии путей, типа hosphoryla-Доном и glycosylation. Так что организмы могут иметь хорошо по заказу (порядку) величины большее количество белков, чем гены.

proteomics делает попытку к каталогу и характеризовать эти белки, сравнивать изменения(разновидности) в их уровнях выражения при различных условиях(состояниях) (особенно болезнь против здоровья), изучать их взаимодействия, и идентифицировать их функциональные роли. Ученые полагают, что есть мощное различие, которое будет сделано между молекулярной функцией изолированного белка и функции этого

Белок в сложной клеточной окружающей среде.

proteomics - не изучение белков один за другим, как традиционно был сделан, но в автоматизированной, крупномасштабной манере. Это требует новых технологий и методов, и значительное усилие в настоящее время посвящается развитию новых инструментов торговли proteomics.

Такие усилия были очень в свидетельстве(очевидности) в "proteomics", конференция, держимая(проведенная,поддержанная) в Сан-Франциско в прошлом месяце. Встреча была треть из трех конференций в названных ряде " Вне 2000 Геном " , который был поддержан Кембриджом Healthtech Институт, Ньютон Верхние Падения (осень), Масса.

Спросим, чтобы определить возможности proteomics, биохимика и молекулярного биолога Ричарда Р-а Бургесса McArdle Лаборатории для Исследования Рака в Университете Висконсина, Мадисона, спикер на конференции, сообщает C*EN, что это является " мешок захвата действий, которые являются всеми в

postgenomics или функциональная genomics область, или, каковы, мы должны знать, чтобы иметь смысл всей genomics арены данных. "

Область (поле) включает следующее:

· Transcriptional копировальный определять " которые гены расшифрованы в RNA в специфическом типе ячейки, стадии связанной с развитием, или государстве (состоянии) болезни, " Бургесс говорит.

· выражение Высокой производительности и очистка белков.

· копировальный Белок, использование двух-мерного геля electrophoresis и массовой спектрометрии, чтобы изучить белки, выраженные в ячейке.

· взаимодействие Белка-белка изучает, чтобы видеть, которые белки функционируют вместе, прежде всего используя технику называемую методом двухгибридного дрожжей.

· анализ Тропы, чтобы понять трансдукцию сигнала и другие сложные процессы ячейки.

· Крупномасштабное сворачивание белка и трехмерные занятия(изучения) структуры.

· Bioinformatics анализ proteomics данных.

' Главная концепция, которую я нахожу, чтобы проникать в область proteomics - то, что Вы не делаете

В методе двухгибридного дрожжей, обязывающем между белком приманки (conjugated к dna - ОБЯЗАТЕЛЬНАЯ область) и белок добычи (conjugated к области активации транскрипции) приносит эти две области в близость, формируя функциональный фактор транскрипции, которые включают репортера ген. Выражение того гена показывает, что приманка взаимодействует с добычей, указывая, они могут быть функционально связаны.

Карты. На основе ткани подобно ним от Hybrigenics (выше) и Бесчисленной Генетики (право) помогают отношениям следа исследователей между наборами Взаимодействующих белков.

Только изучите один белок, поскольку мы делали в течение лет, но Вы изучаете все белки в организме в то же самое время, " Бургесс говорит. " От моей перспективы, простой является и продолжит быть невероятным творческим потенциалом в изобретении способов делать это. "

Обнаружение функции белка

Объяснение для занятий(изучений) взаимодействия белка-белка - то, что белки, которые связывают вместе, имеют тенденцию работать вместе - или по крайней мере более вероятны чем не быть связанными. Идея, что близость и функциональные возможности идут взявшись за руки, могла бы казаться сомнительной, но эта гипотеза была проверена экспериментально.

" Опытным путем, причина, мы заинтересованы взаимодействиями белка-белка - то, что, если Вы можете очерчивать белок, который вовлечен в процесс болезни, весьма вероятным, что это является потенциальной целью препарата(наркотика), " сказал ученый исследования Дэниел Ветцтеин Бесчисленной Генетики, Солт-Лейк-Сити, кто был председатель сессии на proteomics конференции.

В настоящее время, первичная техника для выделяющих взаимодействий белка-белка в биологических системах - метод двухгибридного дрожжей, " генетический метод для анализа взаимодействий белка-белка, " Ветцтеин объяснил на встречу. " Его власть(мощь) в терминах выделяющих взаимодействий белка-белка прибывает от факта, что Вы можете управлять этим как выбор. Вы можете рассматривать миллионы различных взаимодействий белка-белка в дрожжах, и только те дрожжи, которые встают на якорь, производительное взаимодействие белка-белка будет расти. Если они растут, они формируют колонии, Вы можете выбрать их, и Вы можете анализировать их. "

Двухгибридная техника эксплуатирует eukaryotic факторы транскрипции, которые состоят из двух модульных областей: dna - ОБЯЗАТЕЛЬНАЯ область и активация транскрипции делают-

Главный. В технике, два белка сплава сделаны. Первый - сплав между dna - ОБЯЗАТЕЛЬНАЯ область и белок приманки. " Как правило, приманка - белок, который Вы имеете в руке, и Вы заинтересованы определением взаимодействий белка-белка, в которых это участвует, " Ветцтеин сказал. Второй - сплав между областью активации транскрипции и белком добычи, потенциал, взаимодействующий партнер.