Биохимик и лидер группы Стивен Т. Rapunda-Ло и коллеги при Pfizer Глобальном Исследовании и Лабораториях Анн-Арбора Развития, Анн-Арборе, Mich.,
Изучают образцы выражения сердечно-сосудистых белков в животных моделях сердечно-сосудистой болезни, чтобы получить лучшее понимание сердечной болезни и других условий(состояний). " proteomics предлагает большой инструмент, чтобы утвердить составы в различных стадиях трубопровода открытия препарата(наркотика) и в различных моделях эффективности или обработки(лечения), " Rapundalo сказал. " Как продвижения(прогресс) технологии, мы будем непрерывно должны оценить методы, которые могут увеличивать производительность и воспроизводимость наших занятий(изучений). "
Phages и антитела
Одна техника, делающая важный вклад в proteomics - показ phage. В показе phage, peptide или библиотеках белка созданы на вирусных поверхностях и screened для деятельности в массе. peptides или белки остаются связанного с генами, которые кодируют их, создание
Их легкий выделять.
" Это симпатично ясно к каждому, что обычный путь анализа потенциальных генов болезни на по одному основании - не приемлем, " сказал Скотт Чаппел, старший вице-президент исследования в Dyax, Кембридже, Массе. " Что мы должны иметь - процесс, который собирается мочь к - обнадеживающе быстро, в автоматизированной помощи смысла в очистке изделия гена, помощь идентифицирует ее функцию, утверждает это как цель, и определяет ее роль в процессе болезни, так возможно это может самостоятельно стать терапевтическим. "
phage показ заполняет эту потребность, он сказал. Это может использоваться обычно, чтобы определить " обязательные молекулы к сотням целевых белков в течение недель, " отмеченный Chappell.
Исследователи в Phylos, Лексингтоне, Массе., развили технологию, подобную показу phage называемому Обильностью. Молекулы Обильности - conjugates, в котором peptide или белок связаны химически с mRNA, который кодирует это, делая это возможный легко идентифицировать peptide или белок в экспериментах экранирования близости. Технология основана в значительной степени на работе Ричардом В. Роберцом, теперь помощник профессора химии в Калифорнийском Институте Технологии, и молекулярного профессора биологии Джек В. Сзостак Больницы Генерала Штата Массачусетс, Бостон [Proc. Natl. Acad. Sci. США, 94,12297 (1997)].
Технология Обильности более проста чем показ phage, потому что никакие живущие вирусы не вовлечены, и это потенциально может использоваться, чтобы создать большие и более сложные peptide библиотеки чем те accessible с показом phage, согласно Phylos исследуют ученого и председателя сессии конференции Томас Куджек. Молекулы Обильности могут использоваться, чтобы идентифицировать ligands для важных рецепторов, изучать новые взаимодействия белка-белка, находить ключевой фермент substrates и факторы транскрипции, и идентифицировать цели препарата(наркотика). Phylos ученые недавно демонстрировал, что несколько известного substrates tyrosine kinase v-abi мог быть отобран от проteomic библиотеки rna - сплавы БЕЛКА.
Тем временем, ученые в Biovation, в Абердине, Шотландии, развивают технологию по имени Biodisplay, в котором массовая спектрометрия используется, чтобы идентифицировать фрагменты антитела, которые связывают человеческие белки. Техника упрощает обнаружение антител, которые связывают цели маркировкой каждый фрагмент антитела с peptide encoding последовательность или "штриховой код".
Biovation исследуют менеджера Фиону Адаира, объяснил, что фрагменты, столь идентифицированные могут использоваться, чтобы проверить образцы ткани на присутствие соответствующих целевых белков. Функция тех белков может тогда быть изучена и их уместность, поскольку терапевтические или диагностические агенты определили.
Чипы и множества
Диапазон и технологий на основе множества на основе чипа также появляется для идентификации и характеристики индивидуальных белков и для копировального из выражения белка в ячейках. В Ciphergen Biosystems, Palo Альт, Калифорния, например, исследователи развили стратегию на основе чипа " который позволяет биологам мочь делать химию белка и анализ белка и включать это непосредственно в их биологическое исследование, " сказал старший ученый Ique A. Dalmasso.
В технике, называемой ProteinChip, сырой(грубый) биологический образец помещен в множество, способное к завоеванию поднабора белков от образца. Поверхность множества может быть химическая поверхность с широкой спецификой так, чтобы это ловило(поймало) целые классы(занятия) белков-возможно сотен или тысяч из них в тот же самый
Время. Или это может быть чрезвычайно определенное, типа антитела-, фермент-, или поверхность на основе рецептора, которая является высоко отборной для нескольких белков. После шага захвата, множество ProteinChip вымыто, чтобы уменьшить неопределенное закрепление, и сохраненные белки на поверхности проанализированы лазером desorption/ionization время ГОСПОЖИ рейса(полета).
Молекулярная Организация, Guilford, Конн., приспособил метод увеличения сигнала, называемый, катя увеличение круга для анализа выражения белка высокой производительности на biochips. Выражение proteomics с катящимся увеличением круга, кажется, имеет знаменательно большую чувствительность и будет большим количеством scalable чем с 2-ыми гелями и массовой спектрометрией, согласно Стивену Ф. Нгсмор, главный операционный директор при Молекулярной Организации.
Опытные образцы двух катящихся чипов белка увеличения круга недавно использовались, чтобы измерить allergen - определенный immunoglobulin-E и 48 факторов роста в терпеливых образцах. Чипы имели sensitivities приблизительно 1 picogram в мл и динамический диапазон пяти заказов(распоряжений) величины. " Требуется нас три к четырем неделям к таможенным чипам проекта для от 20 до 50 белков интереса(процента), " Kngsmore сказал.
bioinformatics
Сложные(искушенные) bioinformatics инструменты, чтобы обратиться с изобилием данных, появляющихся от занятий(изучений) proteomics - также при развитии Одна компания, Proteome, Беверли, Масса., развил собрание proteomics баз данных для образцовых организмов, типа дрожжей, fungal патогенная Кандида albicans, и червь Caenorhabditiselegans. Базы данных содержат, индексировал биологическую информацию относительно белков, который является полезным для аннотирования и интерпретации экспериментальных следствий proteomics занятия(изучения). Поднабор баз данных свободен академическим пользователям, и подписной версии баз данных
Уважаемый посетитель!
Чтобы распечатать файл, скачайте его (в формате Word).
Ссылка на скачивание - внизу страницы.