Способы искусственных индукции и ускорения апоптоза. Генная терапия, фотодинамическая терапия, страница 2

AIF

Apoptosis Inducing Factor

Апоптоз индуцирующий фактор

Флавопротеин, высвобождаемый из митохондрий через PT поры. AIF переносится в ядро клетки, где посредством активности флавопротеина происходит разделение ДНК на фрагменты

ANT

Adenine Nucleotide Transporter

Аденина нуклеотида транспортер

Находится во внутренней митохондриальной мембране. Действует как переносчик аденина нуклеотида вместе с субъединицей  PT поры

APAF-1

Apoptosis-Activating-Factor-1

Апоптоз активирующий фактор-1

Действует как адаптер, участвующий в образовании апоптосомы. Обладает CARD фрагментом молекулы

Apoptosis

Апоптоз

Программируемая клеточная гибель. Представляет собой организованную разборку клетки на апоптотические тельца. Не вызывает воспаления

Apoptosome

Апоптосома

Состоит из цитохрома С, прокаспазы 9 и  APAF-1. Стехиометрия неизвестна. Образование апоптосомы происходит под действием цитохрома С, высвобождаемого митохондриями. Образование кластера прокаспазы 9 в апоптосоме активирует данный проапоптотический фермент

Bax

Bcl-2 Associated X protein

Связанный с Bcl-2 X белок

Обладающие проапоптотическими свойствами представитель семейства  Bcl-2. Содержит фрагменты BH1 - BH3

Bcl-2 and Bcl-xL

B-Cell Lymphoma

B-клеточная лимфома (белок, участвующий в патогенезе данного заболевания)

Локализован на внешней митохондриальной мембране и обладает антиапоптотическими свойствами. Содержит фрагменты BH1 - BH4

BH domains

Bcl-2 Homology domains

Гомологичные участки молекул Bcl-2

Известны четыре таких фрагмента (BH1 - BH4). У антиапоптотических белков семейства Bcl-2 молекула содержит все четыре фрагмента, а у проапоптотических белков Bcl-2 таких фрагментов меньше

Bid и tBid

BH3-Interacting Domain death agonist (usual and truncated)

Активный фрагмент со свойствами агониста апоптоза (обычный и усеченный)

tBid – проапоптотический представитель семейства Bcl-2. Растворим и содержит фрагмент BH3

CAD (a.k.a. DFF 40)

Caspase-Activated DNase (a.k.a. DNA Fragmentation Factor, 40kDa)

Активируемая каспазой ДНКаза (активируемый каспазой фактор фрагментации ДНК с массой 40 килодальтон)

Активируется каспазой 3 и вызывает фрагментацию хроматина

CARD

Caspase Recruitment Domain

Мобилизующий фрагмент каспазы

Молекулы некоторых прокаспаз содержат девять CARD. APAF-1 также содержит данный фрагмент. Прокаспаза-9 и APAF-1 связываются данными участками молекул при образовании апоптосомы

Caspase

Cysteinyl aspartate-specific protease

Цистеин аспартат-специфическая протеиназа

Выделяют каспазы инициаторы протеолитического каскада (каспазы 2, 8, 9, 10), каспазы эффекторы процесса апоптоза (3, 6 и 7), а также каспазы эффекторы воспаления (1, 4 и 5). В активных центрах каспаз находят цистеиновые остатки, а протеолиз происходит в аспартатных локусов белков-мишеней. Активные каспазы – это тетрамеры, состоящие из двух больших по размеру и двух меньших по размеру единиц. Активные каспазы образуются при расщеплении протеинов прокаспаз

CD-95 и TNF-R1

Cell Death-95 and Tumour Necrosis Factor Receptor-1

Клеточной смерти рецептор 95 и фактора некроза опухолей рецептор 1

Образуют часть DISC. Рецепторы активируются своими лигандами CD-95L и TNF-α.

CD-95L и TNF-α

Cell Death-95 Ligand and Tumour Necrosis Factor-α

Лиганд рецептора смерти 95 и фактор некроза опухолей-α

Лиганды рецепторов смерти.

cFLIP

Cellular FLICE Inhibitory Protein

Белок ингибитор клеточного FLICE

Псевдокаспаза, которая связывается с DED участками белков промотеров апоптоза (таких как FADD), предотвращая связывание каспаз в апоптосоме. Гомологичен прокаспазе 8, но не содержит активный центр с аминокислотной последовательностью QACXG. Как и прокаспаза 8, подвергается расщеплению, высвобождая два больших по размерам и два меньших по размерам фрагмента. Не подвергается второму расщеплению, которое удаляет из молекулы каспаз тормозящий про-фрагмент. В результате первого расщепления вступает в прочное соединение с DISC

Cyt. C

Cytochrome C

Цитохром С

Необходим для переноса электронов в митохондриях при окислительном фосфорилировании. Высвобождается из митохондрий с участием PT пор и начинает образование апоптосом

DD

Death Domain

Фрагмент смерти

Рецепторы смерти и протеины адаптеры соединяются с DISC посредством фрагментов смерти

DED

Death Effector Domain

Эффектор фрагмента смерти

Находятся в составе молекул FADD и прокаспазы 8. Эти белки связываются посредством DED фрагментов

DISC

Death-Inducing Signalling Complex

Вызывающий смерть сигнальный комплекс

Составляется рецепторами смерти их лигандами и адаптерами (FADD и др.)

Effector Caspases

Каспазы эффекторы

Каспаза 3 активируется такими каспазами инициаторами как каспаза 8 и каспаза 9. Активированные каспазы эффекторы подвергают протеолизу определенные протеины, вызывая апоптоз

Endo-G

Endonuclease G

Эндонуклеаза G

Высвобождается из митохондрий через PT поры. Перемещается в ядро, где разбирает на фрагменты одноцепочечную ДНК

FADD

Fas-Associated Death Domain

Связанный с Fas (CD95) молекулярный фрагмент смерти

Протеин адаптер в составе DISC

FLICE

FADD-Like IL-1β-Converting Enzyme

FADD-подобный интерлейкин-1β превращающий фермент

Каспаза 8

IAP

Inhibitors of Apoptosis Proteins

Ингибиторы белков апоптоза

Угнетают активность каспаз 3 и 8 Впервые были выявлены у бакуловируса. Своими действиями обеспечивают репликацию вируса в инфицированной клетке. Содержат гомологичные участки  BIR 1-3 (Baculovirus IAP repeats, то есть общие структурные элементы молекул ингибиторов апоптоза бакуловируса). Участки IAP прилежащие к  BIR2 необходимы для связывания и торможения каспаз. Действию IAPs противостоит эффект Smac/DIABLO

ICAD (a.k.a DFF 45)

Inactive CAD (a.k.a DNA Fragmentation Factor, 45kDa)

Неактивная ДНКаза (активируемый каспазой фактор фрагментации ДНК с массой 40 килодальтон)

Молекулярный комплекс CAD и протеина-ингибитора.  Каспаза 3 отщепляет протеин-ингибитор и высвобождает активный  CAD

Initiator Caspases

Каспазы инициаторы

Инициаторы каспазы (прокаспазы 8 и 9) способны к аутоактивации при кластеризации в апоптосоме. Активный инициаторы активируют каспазы эффекторы, например, прокаспазу 3

MBR or PBR

Mitochonrial or Peripheral Benzodiazepine Receptor

Митохондриальный

или периферический бензодиазепиновый рецептор

Находится во внешней митохондриальной мембране и составляет PT пору

PARP

Poly (ADP-Ribose) Polymerase

Полиаденозиндифосфатрибозополимераза

Фермент активируется в ответ на повреждение ДНК. Добавляет аденозиндифосфат рибозные полимеры к ядерным белкам, и гистонам в том числе. Это стимулирует процесс восстановления структуры ДНК  

PT пора

Mitochondrial Permeability Transition Pore

Пора митохондриальной мембраны, определяющая ее проницаемость

Открытие РТ поры позволяет таким белкам как AIF, эндонуклеаза G и Smac/DIABLO выйти в цитозоль и вызывать апоптоз. PT пора в частности состоит  из  ANT и VDAC

Smac/DIABLO

Second Mitochondrial Activator of Caspases/Direct IAP Binding protein

Вторичный активатор каспаз/белок, непосредственно связывающий IAP

Белок высвобождается из митохондрий через PT поры и снижает активность  IAP, то есть оказывает проапоптотическое действие

VDAC

Voltage Dependent Anion Channel

Вольтаж-зависимый анионный канал

Находится во внешней митохондриальной мембране, где составляет PT пору